首款！中国地方鸡专用芯片“神农1号”研发成功！_种质_基因组

3月16日，我校康相涛教授团队基于前期鸡泛基因组研究成果与公共数据，开拓了适用于我国地方鸡基因组系列液相芯片——“神农1号”。
该系列芯片的成功研发，搭建了用于地方鸡种质资源鉴定、精准评价、保护与开拓利用的高效技能平台，对我国家禽种业振兴与可持续发展具有主要的意义。

58个地方鸡品种地理分布

该系列芯片采取模块组合的设计思路：模块I是利用66.5M泛基因组序列，设计5K标记；模块II是整合成长、繁殖、屠体等性状GWAS的功能位点，设计5K标记；模块III是整合我国58个地方鸡种中高频SNP位点，设计30K标记；模块IV是整合成长、羽色等性状的缘故原由InDel、SV、PAV突变位点。
集成上述模块，创制了40K、5K地方鸡基因组系列芯片——“神农1号”。

“神农1号”40K地方鸡基因组芯片位点分布

“神农1号”地方鸡基因组液相芯片试剂盒

河南农业大学家禽团队是教诲部、农业部科研创新团队。
现有16名骨干成员，个中教授9人、副教授3人。
团队带头人康相涛教授先后荣获全国前辈事情者、中华农业英才奖和首届国际种业科学家奖等。
团队长期环绕地方鸡种质资源保护和利用开展研究，先后主持承担国家“863”操持、国家自然科学基金、神农种业实验室“一流课题”项目等国家和省部级科研项目；主持造就国审新品种2个，完成的《中国地方鸡种质资源精良性状发掘创新与运用》获国家技能发明奖二等奖、《地方鸡保护利用技能体系创建与运用》获国家科学技能进步奖二等奖，授权国家发明专利46项，制订国家和地方标准10项，揭橥中英文论文500余篇。

上述研究成果的取得紧张依托于神农种业实验室、农业屯子部畜禽资源（家禽）评价利用重点实验室、河南省鸡种质资源创新与利用重点实验室、河南省家禽育种国际联合实验室和河南省家禽种质资源创新工程研究中央等省部级研究平台，以及保存了29个特色资源、举动步伐设备一流的河南农业大学家禽种质资源场。

1．Wang K, Hu H, Tian Y, Li J, Scheben A, Zhang C, Li Y, Wu J, Yang L, Fan X, Sun G, Li D, Zhang Y, Han R, Jiang R, Huang H, Yan F, Wang Y, Li Z, Li G, Liu X, Li W, Edwards D, Kang X. The Chicken Pan-Genome Reveals Gene Content Variation and a Promoter Region Deletion in IGF2BP1 Affecting Body Size. Mol Biol Evol. 2021, 38(11):5066-5081.

2．https://omia.org/home/

3．Wang M, Thakur Mukesh, Peng M et al, 863 genomes reveal the origin and domestication of chicken. Cell Research, 2020, 30:693–701.

4．https://www.animalgenome.org/cgi-bin/QTLdb/GG/index

本期编辑：白家瑜

图文来源：河南农业大学官方微信